رسالت این رشته تربیت گروهی از صاحبنظران برخوردار از آگاهی های لازم در زمینه تاریخ علوم پزشکی و به خصوص تاریخ علوم پزشکی در دوره تمدن اسلامی است که قادر به انجام پژوهش های گسترده تاریخی و میراث گرانقدر پزشکی به منظور بازیابی اطلاعات علمی، فلسفی و تجربه به جای مانده از آثار حکماء و دانشمندان پیشین ، همچنین تالیف منابع علمی و انتقال دانش مربوطه به جامعه علمی ومخاطبین خود می باشد. اهداف کلی این رشته ، بازشناسی میراث پزشکی بشر وسیر تحولات آن و سهم ایران و ملل اسلامی در نوآوری ها و نوآفرینی ها در دانش پزشکی گذشته و آثار آن بر علوم پزشکی امروز و تحلیل ریشه یابی دلایل پیشرفت و افول آن و بهره گیری از تجارب گذشته برای بالندگی علمی و توسعه آینده می باشد.

 در راستای اهداف فوق ، دانشکده طب سنتی با توجه به امکانات و اعضاء محترم هیئت علمی درخواست تاسیس رشته مذکور را نمود که پس از بازدید ، در دویست و هشتاد و هشتمین جلسه شورای گسترش دانشگاه­های علوم پزشکی، مورخ 1401/7/26با راه­اندازی رشته تاریخ علوم پزشکی در مقطع دکتری تخصصی (Ph.D)  در دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی ایران  با ظرفیت پذیرش2 دانشجو برای یک دوره در دانشکده طب سنتی موافقت گردید.